通常荧光染料化合物带有羧酸或者NHS活化酯，所以与多肽接合时需要多肽有氨基官能团，所以通过在序列中可以修饰在Lys侧连氨基上，在C端时需要增加Lys或通过乙二胺（ED：NH2CH2CH2NH2）连进行连接。如Lys（Biotin），ED-Biotin，EDDnp等。
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